A vegyes alagútkezelés lehetővé teszi annak eldöntését, hogy mely alkalmazások ne használják a VPN-t, amikor csatlakoznak az internethez. Minden olyan alkalmazás, amelynél a VPN-kapcsolat le van tiltva a vegyes alagútkezelésben, még a VPN-kapcsolat létrehozása esetén is VPN használata nélkül csatlakozik az internethez. Az eszközön lévő összes többi alkalmazás a VPN-en keresztül csatlakozik.
Ez hasznos lehet az instabil vagy az olyan alkalmazások esetében, amelyek a VPN-kapcsolat létrejöttekor leállhatnak; ilyenek például a banki és az e-mail alkalmazások, az üzenetküldő alkalmazások és a kézbesítési szolgáltatások.